绝大多数和田玉，都有或多或少的瑕疵，有些人认为，有瑕疵就代表着不是一块好玉。这种说法太绝对了，因为籽料历经千万年岁月变迁，受过一些外力的损伤太常见了，所以，几乎不存在完全没有瑕疵的料子。更有甚者，某些商人称自己的料子是完美的，其实很大可能是经过处理的假料，相反，有点瑕疵反而是籽料的最真实状态。
裂
十籽九裂，在和田玉形成籽料的漫长过程中，磕磕碰碰在所难免，裂是非常正常的存在。而裂，也像人类的伤口一般，有大有小，有深有浅，有的已经是老伤痊愈只留疤痕，有的是新伤，还有可能伤势加剧蔓延……
所以根据类型的不同，裂也分为老裂和活裂。老裂一般是形成时间已经很长了，并不会再继续向内或向周边衍生，所以对玉整体没什么影响。有的本来就比较老气的籽，老裂周围往往还带有沁色，这种老裂，要作假到逼真的程度比较繁琐，所以也被视为籽料的特征之一。
活裂则需要警惕，就像是“内伤”，会恶化一样，活裂往往隐藏在料子内部，不易察觉，且在日常的佩戴、盘玩中，可能会慢慢加剧延伸，严重的甚至令料子完全断裂。
活裂影响料子质量，在选购的时候最好是打灯照一照，老裂的话可能会影响观瞻，不过一点裂纹都没有的玉石是非常少见的，多少都会有点瑕疵。若是制造成品，只要裂不是太夸张，是可以通过很多方法处理裂的部分，这一点不需要太过担心。
僵
也称之为浆，是玉和石、棉等杂质共生。僵和裂一样，也分为活僵死僵，一般来说，带僵的料子价值一般，因为石性重，但也有的人会特意选择带死僵的料子。俗话说僵边出细肉，而且现在料子本就紧缺，带僵的料子也是非常好的巧雕题材。
但带有活僵的料子则不能选择，和活裂一样，它们一般隐藏在玉肉内部，具有较强的穿透性，会到处乱窜，对玉质有负面影响。可以打灯照一照，玉石会在光线照射下呈半透明状态，有僵的部分，光线很难渗透。
棉
棉的成分为二氧化硅，是在玉石内部的白色结晶体，有的比较明显能肉眼看到，有的棉比较细小，隐藏在内部肉眼较难看出，可以通过打光观察。
棉的形状，有云雾状、点状、片状，棉对和田玉的价值产生一定影响，一般情况下，棉越明显，这块玉石的价值越低，就算玉质再好也不行。当然也有部分玉雕师可以利用好这种棉絮，令其作为特点巧雕，大大程度的提高成品价值和意境，这就需要比较妙的巧思设计了。
水线
在地质运动的影响下，有些玉石内部会产生断裂、二次挤压，在这个过程中，断裂部分慢慢融合，有形成了二次结晶，就是水线。大部分的水线肉眼都能看到，呈白色半透明状，有些水线很细，需要借助强光才能发现。
一般情况下，青海料中出现水线的概率较大，有的青海料中，水线纵横交错连成一片，新疆料中也有可能出现水线。水线不比裂、黑点那么明显，在雕刻的时候也比较容易掩盖规避，所以不严重的话，对玉石价值的影响不大，且有的带水线的料子，要更加细腻些。
